সামরিক চিকিৎসা সার্ভিস মহাপরিদপ্তর সশস্ত্র বাহিনীর জন্য সার্বিক স্বাস্থ্য ও চিকিৎসা বিষয়ে পরিকল্পনা ও নীতিমালা প্রণয়ন, মেডিকেল স্টোরস এবং সরঞ্জামের বাৎসরিক পরিকল্পনা, ক্রয় ও নিয়ন্ত্রণ, এএমসি, এডিসি ও এএফএনএস অফিসারদের দেশে-বিদেশে উচ্চতর প্রশিক্ষণ এবং বিশেষজ্ঞ পুল নিয়ন্ত্রণসহ গ্রেডিং ও ক্লাসিফিকেশন প্রদান করে থাকে। এ ছাড়াও এ মহাপরিদপ্তর চিকিৎসা বিষয়ক গবেষণা কাজকে উৎসাহিত এবং জাতীয় ও আন্তর্জাতিক হালনাগাদ কারিগরী উন্নয়ন সম্পর্কে ওয়াকিবহাল থাকাসহ সার্বিক জাতীয় স্বাস্থ্য ব্যবস্থা উন্নয়নের লক্ষ্যে বিভিন্ন জাতীয় ও আন্তর্জাতিক সংস্থার সাথে সমন্বয়ের মাধ্যমে যথাযথ নীতি প্রণয়নে অবদান রাখে । আন্তঃবাহিনী মেডিকেল ইউনিটসমূহ যেমন, আর্মড ফোর্সেস মেডিকেল ইনস্টিটিউট (এএফএমআই), আর্মড ফোর্সেস ইনস্টিটিউট অব প্যাথলজি (এএফআইপি), আর্মড ফোর্সেস মেডিকেল স্টোরস ডিপো (এএফএমএসডি) এবং আর্মড ফোর্সেস ফুড অ্যাড ড্রাগস ল্যাবরেটরী (এএফএফএন্ডডি ল্যাব) এর উপর কারিগরী আদেশ ও নিয়ন্ত্রণ এ মহাপরিদপ্তরের উপর ন্যাস্ত রয়েছে। সামরিক চিকিৎসা সার্ভিস মহাপরিদপ্তর কর্তৃক সশস্ত্র বাহিনীর সকল সদস্য এবং তাদের পরিবারবর্গ এবং অন্যান্য প্রাধিকৃত ব্যক্তিবর্গের মানসম্মত চিকিৎসা সেবা প্রদান নিশ্চিত করার প্রচেষ্টা অব্যাহত রয়েছে। গভীর দেশপ্রেম, উঁচু মনোবল এবং সর্বোপরি আল্লাহর উপর অবিচল আস্থা ও বিশবাস রেখে রোগীদের সেবায় আত্মোৎসর্গ করতে সামরিক চিকিৎসা সার্ভিস মহাপরিদপ্তর বদ্ধপরিকর। সমরে ও শান্তিতে রাখিব সুস্থ, সুস্থ্য হাসিতে উদ্দীপ্ত সশস্ত্র বাহিনী এবং সেবায় ও ত্যাগে রহিব সমুজ্জ্বল এই মূল মন্ত্রে দীক্ষিত হয়ে, আর্মি মেডিকেল কোর, আর্মি ডেন্টাল কোর এবং আর্মড ফোর্সেস নার্সিং সার্ভিসেস দৃপ্ত পদক্ষেপে এগিয়ে চলেছে।