গণপ্রজাতন্ত্রী বাংলাদেশ সরকারের Rules of Business, 1996-এর Schedule I এবং Allocation of Business Among the Different Ministries and Divisions (Revised up to April 2017) অনুসারে প্রতিরক্ষা মন্ত্রণালয়ের কার্যাবলি নিম্নরূপ:

১. বাংলাদেশের প্রতিরক্ষা।        

২. জাতীয় জরুরি অবস্থা/যুদ্ধ ঘোষণাকালীন প্রতিরক্ষা সার্ভিসের পরিকল্পনা, সমন্বয় ও মোতায়েন  করা ব্যতীত বাংলাদেশের প্রতিরক্ষা সার্ভিসের ও বাংলাদেশের যে কোন সশস্ত্র বাহিনীর সঙ্গে সংযুক্ত বা পরিচালিত সশস্ত্র বাহিনী এবং বেসামরিক প্রশাসনের সাহায্যার্থে নিয়োজিত থাকাকালে প্রতিরক্ষা সার্ভিসের কার্যাবলি সমন্বয় ও নিয়ন্ত্রণ করা।     

৩. সেনা, নৌ ও বিমানবাহিনীর পূর্তকাজ।       

৪. সাইফার দলিলপত্র প্রস্ত্তত।     

৫. যুদ্ধরতদের জন্য যথাসম্ভব প্রযোজ্য করার নিমিত্ত আন্তর্জাতিক রেডক্রস এবং জেনেভা কনভেনশনস।

৬. মন্ত্রণালয়ের আওতাধীন বাহিনীর জন্য বীরত্ব পুরস্কার ও ভূষণ।     

৭. সামরিক ভূমি ও ক্যান্টনমেন্ট।     

৮. আবহাওয়া পর্যবেক্ষণ।     

৯. সশস্ত্র বাহিনীর সকল সদস্যদের দণ্ড মওকুফ স্থগিত ও অবকাশ ইত্যাদি।    

১০. জাতীয় সার্ভিস এবং বাংলাদেশ ন্যাশনাল কোর (বিএনসিসি)।

১১. ক্যাডেট কলেজ সংক্রান্ত বিষয়াবলি।     

১২. মহাকাশ গবেষণা ও দূর-অনুধাবন সংস্থা (স্পারসো) সংক্রান্ত বিষয়াবলি।     

১৩. প্রতিরক্ষা বাজেট থেকে বেসামরিক সার্ভিসের ব্যয় নির্বাহ।

১৪. হাইড্রোগ্রাফিক জরিপ এবং নৌচালন চার্ট তৈরী (বাংলাদেশের অভ্যন্তরীণ হাইড্রোগ্রাফিক জরিপ এবং অভ্যন্তরীণ নৌচালন চার্ট তৈরী  ব্যতীত)।   

১৫. বাংলাদেশ জরিপ। 

১৬. সশস্ত্র বাহিনীর বাজেট, আইনগত ও সংবিধিবদ্ধ বিষয়াবলি।     

১৭. আর্থিক বিষয়সহ সাচিবিক প্রশাসন।    

১৮. মন্ত্রণালয়ের অধীন দপ্তর এবং সংস্থার প্রশাসন ও নিয়ন্ত্রণ।     

১৯. আন্তর্জাতিক সংস্থার সঙ্গে লিয়াজোঁ এবং  মন্ত্রণালয়ে বরাদ্দকৃত বিষয় সম্পর্কীয় অন্যান্য দেশ ও বিশ্ব সংস্থার সঙ্গে চুক্তি ও সমঝোতার বিষয়াবলি।       

২০. মন্ত্রণালয়ে বরাদ্দকৃত  সকল আইন ও বিষয়াবলি।

২১. মন্ত্রণালয়ে বরাদ্দকৃত যে কোন বিষয়ে তদন্ত এবং পরিসংখ্যান।

২২. আদালতে কর্তৃক গৃহীত ফি ব্যতীত মন্ত্রণালয়ে বরাদ্দকৃত যে কোন বিষয় সম্পর্কিত ফি।